Las colecciones de la Biblioteca son híbridas, esto significa, colecciones físicas (diferentes formatos: impresas, microfilm, microfichas, dvd, cd-rom) y colecciones electrónicas,  conformadas por libros, revistas, tesis doctorales y trabajos de grado investigaciones de la PUJ, folletos, partituras, mapas, videos (películas), grabaciones sonoras, audio- libros, diapositivas.

Además la Bbiblioteca cuenta con la suscripción a importantes bases de datos bibliográficas, en todas las áreas del conocimiento de interés a los programas académicos y a los proyectos de investigación de la Universidad.