Curso de Posgrado WebBased

Eventos

Enseguida encontrará usted algunas de las noticias y los eventos más recientes relacionados con el Instituto de Genética Humana (IGH). 

Simposio Procesos Geneticos

 

Encuentro de sensibilización sobre la distrofia muscular

 

Martes 4 de Octubre de 2016 Auditorio Alfonso Quintana Cárdenas, S.J. Sala A ¿ Edificio 20 (Jorge Hoyos Vásquez S.J). Pontificia Universidad Javeriana Comité organizador: Fernando Suárez Obando, William Castro Pérez, Reggie García Robles.

8:30 ¿ 8:45 Charla de apertura. Dr. Fernando Suárez Obando.
8:45 ¿ 9:15 Fundación colombiana para la distrofia muscular. William Castro Pérez.
9:15 ¿ 9:45 Generalidades de la Distrofia Muscular de Duchenne/Becker. Dra. Tatiana Pineda
9:45 ¿ 10:15 Refrigerio
10:15 ¿ 10:45 Clínica de enfermedades neuromusculares - Hospital Universitario San Ignacio. Dra. Sonia Millán
10:45 ¿ 11:15 Presentación de resultados de proyecto de investigación de Distrofia Muscular de Duchenne/Becker. Dra. Paola Ayala.
11:15 -11:45 Presentación de la guía de práctica clínica para la detección temprana, atención integral, seguimiento y rehabilitación de pacientes con diagnóstico de distrofia muscular. Dra. Luz Helena Lugo Agudelo.
11:45 ¿ 12:00 Cierre con videos de historias de vida de pacientes afectados con Distrofia Muscular. William Castro Pérez.
12:00 Almuerzo de cierre.
INSTITUTO DE GENETICA HUMANA

Semillero de Epigenética y cáncer de pulmón participa en Congreso de Medicina de la PUJ

 

 

 

El semillero de investigación de Epigenética y cáncer de pulmón participó en el II Congreso de Medicina de la Pontificia Universidad Javeriana, que se realizó el jueves 29 de octubre en el Auditorio Félix Restrepo de la Universidad.  El objetivo de esta evento fue crear un espacio en el que miembros de la Facultad de Medicina pudieran participar y compartir trabajos de investigación, fomentar no sólo la actividad académica sino la experiencia y el proceso de crear conocimiento.

Este Congreso, organizado por el grupo estudiantil MAJIIS, contó con la participación del Dr. Benigno Rodríguez, médico javeriano, infectólogo y profesor adjunto de la división de enfermedades infecciosas y VIH de la Universidad Case Western Reserve; el Dr. Javier Eslava-Schmalbach; la Dra. Patricia Hidalgo; la Jefe Danuby Adriana Buitrago, y la jefe María Ximena Reyes como jurados.


La ponencia oral presentada por Daniela Troncoso, integrante del Semillero y estudiante de segundo semestre de Medicina, fue "Contribución de NKX2, ROR1 y RUNX2 en la progresión tumoral en cáncer de pulmón". Este proyecto de investigación lo han venido realizando estudiantes de diferentes carreras de la Universidad que hacen parte del semillero de Epigenética y cáncer de pulmón. Su presentación obtuvo el primer puesto en la categoría de presentación oral. El premio que recibió fue una beca KAPLAN para realizar el curso de preparación para el examen internacional de inglés, TOEFEL.

 

Programa Simposio de Enfermedades Huérfanas Sociedad Colombiana de Pediatría Instituto de Genética Humana - Facultad de Medicina Pontificia Universidad Javeriana

 
  • Fecha: Mayo 11 de 2016.  8:00 ¿ 15:00
  • Lugar: Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá D.C.
  • Sótano del edificio N°95, Manuel Briceño Jáuregui S.J. Auditorio Jaime Hoyos. 

 

Hora Actividad

7:30 - 8:00

Registro

8:00 - 8:15

Bienvenida al evento 

Dr. Fernando Suárez Obando MD, MSc

8:15 - 9:00

Aproximación a los defectos congénitos y síndromes dismórficos

Dr. Ignacio Zarante M., MD PhD

9:00 - 9:45

Aproximación clínica a los errores innatos del metabolismo

Dra. Lina Mora Barreto, MD

9:45: - 10:15

Refrigerio

10:15 - 11:00

Aproximación molecular a las enfermedades huérfanas

Dra. Paola Ayala Ramírez, MSc

11:00 - 11:45

Interpretación clínica de análisis de laboratorio en las enfermedades  huérfanas de origen genético

Dr. Reggie García Robles, MD PhD

12:00 - 13:15

Almuerzo

13:15 - 14:00

Aproximación clínica a las enfermedades neuromusculares en Pediatría 

Dr. Juan Carlos Prieto R., MD MSc

14:00 - 14:45

Aspectos éticos y legales  de las enfermedades huérfanas

Dr. Fernando Suárez Obando, MD, MSc

14:45 - 15:00

Cierre del evento

Dr. Fernando Suárez Obando, MD, MSc

 

Ciencias Omicas y su aplicación en Investigación biomédica Curso Interinstitucional Electivo de Postgrado Agosto - Diciembre, 2016

 

Curso de postgrado dirigido a estudiantes de maestría y doctorado en ciencias básicas biomédicas, ciencias clínicas o afines e investigadores post-doctorales. El curso también es pertinente para profesores, investigadores o profesionales interesados en el tema.

             

1.    Descripción del curso

Este curso ofrecerá una visión integrada de las ciencias omicas y su uso para resolver preguntas de investigación en el ámbito de enfermedades transmisibles e inmunología. El énfasis se hará en genómica, transcriptómica y epigenómica. El curso se desarrollará en dos partes: (1) bases conceptuales y aplicaciones metodológicas de procesamiento de muestras, análisis bioinformáticos para depuración y procesamiento de datos e interpretación de resultados, y (2) desarrollo de ejercicios prácticos aplicados a casos de estudio.   

 

2.    Justificación

La formación de postgrado en ciencias básicas, biomédicas y clínicas requiere conocer cómo las ciencias omicas se han posicionado como herramientas fundamentales para la investigación biomédica. Es necesario que los investigadores tengan bases conceptuales y metodológicas que permitan una comunicación eficaz con los expertos en ciencias omicas y poder profundizar en más aspectos de estas disciplinas.  

 

3.    Objetivo General

Proporcionar una visión integral de los principios, métodos y aplicaciones de las ciencias omicas, particularmente genómica, transcriptómica y epigenómica en el desarrollo de la investigación biomédica. 

 

4.    Objetivos Específicos

 

  • ·         Proporcionar conocimientos conceptuales y de análisis de datos sobre genómica, transcriptómica y epigenómica.
  •  
  • ·         Conocer recursos bioinformáticos que permiten el análisis de datos obtenidos a través de tecnologías omicas.
  •  
  • ·         Generar hipótesis de trabajo para preguntas de investigación biomédica a partir del análisis de datos obtenidos por tecnologías omicas.

 

5.    Metodología

 

La metodología del curso incluye conferencias y discusiones semanales basadas en la web, presentadas por profesores internacionales y nacionales expertos en cada tópico, presentación analítica por estudiantes de postgrado de artículos de investigación sobre los tópicos desarrollados por los conferencistas. Tanto las conferencias como las  presentaciones de los estudiantes se realizan dentro de una red virtual de los programas de postgrado en ciencias biomédicas y enfermedades tropicales en el país, creando así una "aula inter-institucional".   Los estudiantes revisarán la literatura recomendada por los conferencistas y profesores de su programa de postgrado y participarán de forma crítica en discusiones después de cada conferencia. Guiados por los profesores coordinadores del curso en cada institución los estudiantes realizarán revisiones de literatura mediante análisis de artículos actuales de investigación seleccionados por su relevancia a los tópicos de las conferencias previas.  Los estudiantes presentarán dos exámenes: un "quiz"  y una evaluación final.  El coordinador del curso en cada institución recibirá las calificaciones correspondientes a sus estudiantes.  Las universidades participantes podrán incluir actividades académicas adicionales y definir los criterios para la calificación final de sus estudiantes en sus respectivos programas de postgrado.

 

I.  Bases conceptuales y aplicaciones básicas

En la primera etapa del curso se presentarán las bases conceptuales y aplicaciones metodológicas y análisis de datos básicos de genómica, transcriptómica y epigenómica.

II. Practica

En la segunda etapa del curso se desarrollaran demostraciones, tutoriales y discusiones de casos (basados en artículos científicos) enfocadas a la resolución de preguntas de interés biomédico.

 

6.    Literatura recomendada

Los artículos y lecturas recomendadas para cada tópico o revisión de literatura se publicarán en la plataforma Moodle del curso www.cideim.org.co/moodle.

 

7.    Formato del curso

a.        Clases teóricas por expertos nacionales e internacionales

b.        Revisión y discusión de literatura

c.        Demostraciones

d.        Ejercicios teórico-prácticos.

e.        Exámenes

 

 

8.    Calificaciones

  • a.    Participación: 
  • ·   Asistencia 25%
  • ·   Reporte de lectura 25%.
  • Previa asistencia a las conferencias se deberá someter electrónicamente un reporte de lectura de los artículos a tratar que conste de los siguientes puntos:
  • 1.    Describir la pregunta de investigación
  • 2.    Dos a tres hallazgos principales de la investigación que soporten las conclusiones del articulo
  • 3.    Observaciones (opcional): por ejemplo, especificar si los datos del soportan las conclusiones, si la metodología fue apropiada o si encuentra debilidades o fortalezas en el artículo.
  • 4.    Plantee al menos una pregunta dirigida al conferencista sobre el material revisado
  •  
  • Reportes después de la conferencia no serán aceptados
  • Para la evaluación se tendrá en cuenta el cumplimiento en los reportes de lectura de acuerdo al número de artículos revisados y se seleccionaran un reporte para su evaluación.
  • b.    Examen 1. 25%
  • c.    Evaluación Final. 25%

 

 

9.    Créditos:  3

2 horas semanales durante 18 semanas  =  36 horas presenciales  X  (4 horas de trabajo independiente del estudiante) 144 horas / 48 =  3 créditos.

10.  Pre-requisitos:

Haber realizado cursos básicos de posgrado en: Biología Celular, Bioquímica/Biología Molecular e Inmunología y de un tutorial básico del software R.

 

11.  Cronograma del curso (Horario de Sesiones: Martes 10 am ¿ 12 m)

 

 

Día

Tema

Presentador potencial

Sección Teórica

1

09/08/2016

Ciencias OMICAs, generalidades:  Introducción a la genómica, transcriptómica, epigenética, proteómica y metabolómica y  uso de estas tecnologias para resolver problemas biológicos (énfasis en enfermedades infecciosas y/o inmunología)

Richard Burchmore, PhD.

Head of Proteomics

Glasgow Polyomics

2

16/08/2016

Tecnologías de secuenciación y aplicaciones : Sanger, NGS, SMRT, single cell DNA sequencing, RNA sequencing

Victoria Cornelius, PhD.

Resource Centre of MalariaGEN Programme

3

23/08/2016

Bases de datos y aplicaciones:  INSDC, DDBJ, EMBL-EBI and NCBI-GenBank. Acidos nucleicos, estructura y regulación. Proteinas, estructura, motivos y dominios funcionales. Rutas metabólicas. Bases de datos de organismos (ej. 1000 Genomes, VectorBase, EuPathDB, IRD, PATRIC, ViPR)

Equipo de EuPathDB.org

 

4

30/08/2016

Analisis bioinformáticos: comparación de secuencias (BLAST), búsqueda de dominios conservados, determinación de estructuras proteicas, etc. 

Diego Echeverry, PhD

CIDEIM

5

06/09/2016

Filogenetica :  Homólogos, parálogos y ortólogos. Inferencia de relaciones filogenéticas.

Jeffrey Townsend

Yale University, School of Public Health, Biostatistics Department and

Department of Ecology and Evolutionary Biology

6

13/09/2016

Herramientas para inferencias funcionales

Elizabeth-Jeanne Thatcher, Ph.D.

Postdoctoral Fellow, Department of Infectious Disease

University of Massachusetts Medical School, LazareResearch

7

20/09/2016

Generación de hipótesis y Ontología genética 

María Adelaida Gómez, PhD CIDEIM

8

27/09/2016

Bioconductor y R

Najib M. El-Sayed, Ph.D.

Associate Professor

Department of Cell Biology and Molecular Genetics

University of Maryland

9

04/10/2016

Quiz

 

Sección Práctica

10

11/10/2016

Herramientas: Manipulación de archivos en genómica

Juan Manuel Anzola - Corpogen

11

18/10/2016

Herramientas: Genómica. Mapeo y representación de información biológica. Formatos de archivo

Juan Manuel Anzola - Corpogen

12

25/10/2016

Herramientas: Transcriptómica. Mapeo y expresión diferencial

Juan Manuel Anzola - Corpogen

13

01/11/2016

Genómica, caso de estudio: presentación de artículos de investigación estudiantes de doctorado

Estudiante de Doctorado

14

08/11/2016

Microarreglos, caso de estudio: presentación de artículos de investigación estudiantes de doctorado

Estudiante de Doctorado

15

15/11/2016 

Transcriptómica, caso de estudio: presentación de artículos de investigación estudiantes de doctorado

Estudiante de Doctorado

16

22/11/2016 

Epigenómica, metilación del DNA  caso de estudio: presentación de artículos de investigación estudiantes de doctorado

Estudiante de Doctorado

17

29/11/2016

Epigenómica modificación de histonas  caso de estudio: presentación de artículos de investigación estudiantes de doctorado 

Estudiante de Doctorado

18

06/12/2016 

Examen Final

 

 

 

 

 

 

 

 

 

12.  Contactos:

-       Diego F. Echeverri, MSc, PhD. Coordinador de Curso en CIDEIM, Cali

-       Manuel Franco, MD, PhD. Coordinador de Curso en Pontificia Universidad Javeriana Bogotá

-       Coordinadores del Curso en cada institución

-       Alejandra Chamorro, Gestora y Administradora de TICs para E-Learning en CIDEIM, achamorro@cideim.org.co

 

13.  Referencias

·         Vincent AT et al. 2016. Next-generation sequencing (NGS) in the microbiological world: How to make the most of your money. Journal of microbiological methods.doi:10.1016/j.mimet.2016.02.016

·         Calvet G et al. 2016. Detection and sequencing of Zika virus from amniotic fluid of fetuses with microcephaly in Brazil: a case study. The Lancet Infectious Diseases.doi:10.1016/S1473-3099(16)00095-5

·         Tachibana C. 2015. Transcriptomics today: Microarrays, RNA-seq, and more. Science. DOI: 10.1126/science.opms.p1500095

·         Cantacessi C et al 2014. The past, present, and future of Leishmania genomics and transcriptomics.Trends in parasitology.doi.org/10.1016/j.pt.2014.12.012

·         Judes G et al. 2016. High-throughput «Omics» technologies: New tools for the study of triple-negative breast cancer. Cancer Letters.doi:10.1016/j.canlet.2016.03.001

·         Bonetta L. 2008. Epigenomics: Detailed analysis. Nature.doi:10.1038/454795a

 

Anomalías congénitas, línea de investigación del Instituto de Genética Humana

 

 

La principal causa de muerte en niños y niñas de un año y menores de cinco años, tanto en nuestro país como en muchos otros, se debe a las anomalías congénitas. Además, estas causan discapacidades que implican condiciones especiales para los pacientes y su familia. Con este contexto, un grupo de profesores del Instituto de Genética Humana desarrollan diferentes investigaciones en torno a estas enfermedades.

El profesor Ignacio Zarante, MD, PhD, explica en qué consiste el programa de la línea de investigación de enfermedades congénitas del Instituto de Genética Humana, de la Facultad de Medicina.

 


Dentro de los productos de sus investigaciones, el profesor Zarante explica que existen dos de alto impacto. Ambos se puede acceder por internet y son de uso general para conocer sobre las enfermedades congénitas: 

 

¿En qué consisten estas plataformas y quiénes las pueden usar?

 

 

Taller internacional CONTROL EPIGENETICO: MECANISMOS Y APLICACIONES

 

Universidad Andrés Bello Centro FONDAP de Regulación del Genoma Centro de Investigaciones Biomédicas. 

Fecha:   19 y 20 de julio de 2017 Horarios:   9.00¿13.00 hrs y 15.00 a 18.00 hrs Lugar: Auditorio Andrés Bello, Universidad Andrés Bello, Avenida República 239¿Interior Organiza: Martín Montecino, Centro de Investigaciones Biomédicas y Centro FONDAP de Regulación del Genoma, Universidad Andrés Bello. mmontecino@unab.cl Patrocinan: CONICYT/Programa de Cooperación Internacional/Proyecto REDES150109 Centro FONDAP de Regulación del Genoma Universidad Andrés Bello Diagenode¿Chile

Para mayor información. >> 

8TH International Conference on Brith Defects and Disabelities

 

Instituto de Genética Humana - Carrera 7 # 40-62 Edificio 32 Bogotá, D.C Colombia. Teléfono (57 - 1) 3208320 Ext: 2794