1974 

Se abre el programa “Universidad Abierta” con estudios por el sistema de educación a distancia, que a mediados de los años 90 logró llevar la presencia de la Universidad a 650 municipios de Colombia, con el apoyo de 16 Centros Regionales. Con los desarrollos tecnológicos que han tenido lugar desde entonces, el sistema se replanteó y dio paso a los programas de educación virtual. Se debe destacar que en 1994 la Universidad adquiriría la plataforma para virtualización de clases Blackboard. Por su parte, con la creación del Centro de Educación Continuada en 1988, se ampliaría notablemente la oferta académica de la Universidad. 

1976 

Se abre de nuevo la Facultad de Derecho Canónico, que había funcionado entre 1943 y 1968, y que junto con la Facultades de Filosofía y de Teología, integran las Facultades Eclesiásticas de la Universidad. 

1978 

El 20 de noviembre, el Consejo Directivo Universitario aprueba la creación de una Seccional en Cali como otra área de la Javeriana, de naturaleza geográfica, y por lo tanto, con un Vicerrector. Desde 1970 la Universidad había iniciado labores en esa ciudad con un programa de extensión en Contaduría. En 1980 se empezaría a construir la sede que hoy ocupa en la Vía a Pance, al sur de la capital del Valle. Ese mismo año, se crea la Facultad de Ciencias de la Administración. En la actualidad, se tienen tres Facultades: de Ciencias Económicas y Administrativas, de Humanidades y Ciencias Sociales, y de Ciencias de la salud. A partir de la reforma de Estatutos de 2002, la Seccional cuenta con Consejo Directivo y Rector propios. 

1982 

Se crea la Facultad de Ciencias Sociales, que fue de  Ciencias Sociales y Educación de 1988 a 1994, año en que se abrió de nuevo como unidad independiente la de Educación, establecida por primera vez en 1965. Estas Facultades y las de Comunicación Social, -hoy de Comunicación y Lenguaje-, creada en 1970, y la de Artes, que se abriría en 1995, tienen su origen en la antigua Facultad de Filosofía y Letras, creada en 1935, -la segunda que tuvo la Universidad en el periodo contemporáneo-, que puede considerarse como ‘casa matriz’ de un sector importante de la actividad académica de la Javeriana. 

1995 

El Consejo Directivo Universitario aprueba el Reglamento del Profesorado, con categorías y escalafón, elaborado dentro del Proceso de Planeación Estratégica Institucional iniciado en 1990. Años después, en 1998, abierto el Registro Académico de Profesores, el Rector acreditó los primeros Profesores Titulares de la Universidad, de acuerdo con las nuevas disposiciones. En 1993 se había establecido el Fondo para la Promoción Académica de los Profesores, con la finalidad de apoyar la financiación de estudios de posgrado en el exterior. En 2019 se aprobó una reforma integral de este Reglamento. 

1997 

Se crea la Facultad de Estudios Ambientales y Rurales, la última de las 18 que conforman la actual organización académica de la Universidad. En esa Facultad y en la de Ciencias Políticas y Relaciones Internacionales, creada tres años antes, se reagruparía la mayor parte de la labor que entre 1973 y 1994 desarrolló la Facultad de Estudios Interdisciplinarios, establecida para impulsar especialmente esta modalidad académica y el desarrollo de posgrados. 

2003 

El 12 de junio, mediante Resolución del Ministerio de Educación Nacional y luego de dos años de un proceso riguroso de  evaluación y planeación, la Universidad recibió la Acreditación Institucional para un periodo de ocho años, siendo la primera institución que en Colombia alcanzaba tal reconocimiento. En 2020 recibiría de ese mismo Ministerio, la Acreditación Institucional Multicampus, por diez años, primera universidad privada a la que se le ha concedido en esta modalidad. 

2012 

El 18 de abril el Consejo Directivo Universitario modifica el Reglamento Orgánico de la Universidad y crea dos nuevos cargos de Vicerrector en el gobierno general de la Universidad: además de los Vicerrectores Académico, del Medio Universitario y Administrativo, en su Sede Central la Universidad tendrá desde entonces el de Investigación y el de Extensión y Relaciones Interinstitucionales. 

2013 

Con la nueva reforma de Estatutos aprobada por la Santa Sede se establece para las Facultades el cargo de Decano, autoridad responsable de la dirección de las actividades académicas, del medio universitario y administrativas de la respectiva unidad. También se incluyó un cuarto estamento en la conformación de la Comunidad Educativa, el de Egresados, que se une a los de Profesores, Estudiantes y Empleados Administrativos.  Ese mismo año nació el Programa Cardoner dedicado a la formación de Profesores y Empleados Administrativos en Identidad Javeriana.